MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter cetorum MIT 00-7128 plasmid pHCW

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017738	GGA	2	6	1	6	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017738	TTA	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017738	CTG	2	6	116	121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017738	AGT	2	6	148	153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017738	GTT	2	6	499	504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017738	ATG	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017738	ACA	2	6	1629	1634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017738	TTA	2	6	1741	1746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017738	AACA	2	8	1747	1754	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017738	TTA	2	6	1776	1781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017738	T	6	6	3990	3995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017738	A	7	7	4009	4015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017738	TTG	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017738	T	6	6	4084	4089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017738	TAGT	2	8	4101	4108	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017738	A	6	6	4110	4115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017738	T	6	6	4138	4143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017738	T	7	7	4145	4151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017738	CTTTTT	2	12	4152	4163	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017738	ATAA	2	8	4270	4277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017738	T	6	6	4809	4814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017738	G	7	7	6139	6145	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017738	ACT	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017738	T	6	6	6168	6173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017738	ACT	2	6	6184	6189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017738	T	6	6	6189	6194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017738	ACT	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017738	T	6	6	6222	6227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017738	TAA	2	6	6267	6272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017738	A	6	6	6277	6282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017738	GTA	2	6	6283	6288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017738	T	6	6	6338	6343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017738	T	6	6	6396	6401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017738	TTGG	2	8	6441	6448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017738	T	6	6	6466	6471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017738	TTG	2	6	6483	6488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017738	T	6	6	7904	7909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017738	A	6	6	7995	8000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017738	A	6	6	8016	8021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017738	A	6	6	8049	8054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017738	TTAG	2	8	8110	8117	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017738	T	6	6	8162	8167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017738	ATTTTG	2	12	10538	10549	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017738	G	6	6	10549	10554	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017738	G	7	7	10559	10565	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017738	AT	3	6	10599	10604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017738	GATT	2	8	10635	10642	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017738	T	6	6	11857	11862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017738	T	6	6	11869	11874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017738	T	6	6	11889	11894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017738	GTT	2	6	11896	11901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017738	CTA	2	6	11907	11912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017738	TTTC	2	8	11973	11980	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017738	ATC	2	6	11994	11999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017738	ATT	2	6	12064	12069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017738	TAT	2	6	12074	12079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017738	A	6	6	12101	12106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017738	T	6	6	12114	12119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017738	T	6	6	12180	12185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017738	T	6	6	12283	12288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017738	CT	3	6	12295	12300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017738	T	7	7	12318	12324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017738	TAA	2	6	12354	12359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017738	GTT	2	6	12382	12387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017738	CTAA	2	8	12424	12431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.